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高通量测序样品要求

A. 组织/细胞样品:

  • 请使用新鲜取样的实验材料,当场分成小块后立即用液氮或干冰乙醇速冻,保存于-80°C冰箱,用足量的干冰(根据经验,在秋冬季节,如果打包合适,3公斤块状干冰可以维持30-40小时)寄送;
  • 对于微生物样品,请客户如实声明所属物种,对于可能致病的微生物,生工保留拒收的权利;
  • 对于需要进行RNA抽提的样品,可以但不建议将组织在液氮中研磨后用TRIzol悬浮后用普通冰袋寄送,具体情况请先取得沟通。

 

B. 环境样品

  • 如果是新鲜土壤/污泥样品,可以以冰袋运输,不超过3天;
  • 如果是冻存过的样品(-20°C或者-80°C冰箱保存),为避免反复冻融,建议用足量的干冰(根据经验,在秋冬季节,如果打包合适,3公斤块状干冰可以维持30-40小时)寄送;
  • 如果是水体样品,建议采用滤膜过滤后,将滤膜寄送来生工。生工不负责过滤。要求滤膜3张,冰袋运输,不超过3天。其余特殊环境样品,具体咨询生工高通量测序部。

C. DNA样品:

  • 请提供电泳胶图,浓度>20 ng/μl,总量一般1~2 μg。乙醇沉淀DNA或冻干DNA,可冰袋运输,不超过3天。

D. RNA样品:

  • 请提供浓度≥750 ng/μl、总量≥2μg的总RNA样品,样品请去蛋白并进行DNase处理;
  • 请务必提供每个样品具体的浓度、体积、制备时间以及物种来源。最好附上QC数据,可以是电泳胶图、分光光度值、Nanodrop仪器检测数据或者Agilent Bioanalyzer仪器检测数据等;
  • 一般情况下,转录组测序需要Agilent Bioanalyzer仪器检测获得的总RNA 28S:18S≥1,RIN≥7;
  • 小RNA测测序不可采用常规柱式总RNA提取试剂盒,可选择传统总RNA提取法(如乙醇沉淀、异丙醇沉淀等)或者选用专门的小RNA提取试剂盒;
  • 寄送RNA样品请置于1.5 ml离心管中,管上注明样品名称、浓度以及制备时间,管口使用Parafilm封口。在运输前将所有样品管固定于50 ml带盖离心管中,再将50 ml管放在封口袋中。使用足量的干冰运输,并且尽量选用较快的邮递方式,以降低运输过程中样品降解的可能性。

E. 其他特殊样品:

  • ChIP项目至少要求50ng DNA,以Qubit 2.0检测为准。其余具体咨询生工高通量测序部。

F. 其他注意事项

  • 请务必标记清楚并随样品附上样品信息单;
  • 样品请自行保留备份,以便在出现外源污染的情况时能迅速查清原因;
  • 项目完成数据提交后,我方不保存样品,项目结束一个月后将予以清理。